78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1561 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 305 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  61.28 
 
 		 336 aa  384  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  60.4 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  53.36 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  29.89 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  29.78 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  24.81 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  27.83 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  23.88 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  23.88 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  28.79 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  27.83 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  27.4 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  29.94 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  26.76 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  27.78 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  25.12 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  24.62 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  25.59 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  26.39 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  25.96 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.85 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  27.01 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  29.14 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  23.96 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1019  hypothetical protein  22.84 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0792932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1000  hypothetical protein  22.84 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0581  hypothetical protein  22.84 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.38 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  27.87 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  21.8 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.82 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 207 aa  52.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  22.94 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  24.65 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  24.86 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  24.53 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  24.87 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2762  hypothetical protein  30.14 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  24.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  26.29 
 
 		 200 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  24.21 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  22.37 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  25.87 
 
 		 218 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  27.42 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  24.32 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  31.48 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  23.24 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  21.95 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  26.44 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  22.4 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  20 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  22.49 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  22.89 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>