15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1578 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  90.5 
 
 		 221 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  34.7 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2048  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  37.93 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  34.84 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.66 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.22 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  23.11 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.3 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  22.37 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>