51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1239 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  54.79 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  54.79 
 
 		 219 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  54.79 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  38.91 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2048  DSBA oxidoreductase  37.67 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  34.84 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.54 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  35.78 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.49 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0747  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  21.93 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  24.39 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  23.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.23 
 
 		 319 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  22.33 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  23.5 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  19.23 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.2 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  21.8 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 305 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  22.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1263  hypothetical protein  31.46 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.552972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  20.62 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  22.05 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  21.24 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  32.5 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  24.63 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  24.37 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 217 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  21.65 
 
 		 235 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 226 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>