15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2107 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
221 aa  457  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  90.5 
 
 
221 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 
219 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 
219 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 
219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.83 
 
 
206 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2048  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 
225 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960977  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  35.78 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  24 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.91 
 
 
319 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  20.89 
 
 
336 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 
303 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  17.83 
 
 
209 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>