138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2644 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  58.88 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  58.08 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  50.79 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  46.84 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  46.31 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  46.7 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  44.9 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  46.77 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  44.94 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  31.84 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  30.61 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  30.57 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.57 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  29.57 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  31.35 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  28.35 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.49 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  28.18 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  25.52 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.46 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  27.17 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  28.65 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  25.54 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  25 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  29.49 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.36 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  26.88 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.88 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.27 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  25.39 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  25.25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.92 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.6 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.53 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.4 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.06 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.06 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  27.87 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  28.08 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  26.98 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  26.15 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  28.06 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  26.98 
 
 		 297 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  26.23 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  26.23 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  26.23 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  27.72 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  23.32 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  24.67 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25.81 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  26.94 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  26.88 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.61 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  23.81 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  26.26 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  26.04 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  23.66 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  24.73 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  21.62 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  24.02 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  33.04 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  24.48 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  22.7 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  30.63 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  24.48 
 
 		 249 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  29.73 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  29.73 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  23.27 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  21.39 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>