112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1963 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 207 aa  434  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  46.08 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  44.78 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  44.04 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  41.46 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  41.09 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  41.29 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  40.1 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  41.5 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  25.57 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  24.04 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 221 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  26.23 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.12 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  24.15 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  23.3 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.3 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  26.53 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25.63 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  21.46 
 
 		 259 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  20.77 
 
 		 244 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  23.89 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  24.73 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  29.28 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  22.61 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  22.53 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.54 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.44 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  25.95 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  27.32 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.46 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  24.86 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  24.34 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  25.28 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  21.84 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  21.11 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  21.11 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  21.11 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.73 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  26.16 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  23.79 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  22.58 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  21.58 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.73 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  22.04 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.86 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  23.71 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.24 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  22.7 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.24 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  19.8 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  21.13 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 305 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  23.63 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  24.04 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  24.47 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  24.34 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  23.73 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  23.56 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  23.98 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  23.73 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  23.08 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  20.99 
 
 		 300 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  22.87 
 
 		 297 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  19.35 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  23.16 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  22.58 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0010  DsbA oxidoreductase  29.7 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  23.16 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  20.65 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  18.59 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0010  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0010  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  19.9 
 
 		 303 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  23.63 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  23.4 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  22.6 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  22.11 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  22.11 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  22.11 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>