136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0075 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  433  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  45.89 
 
 
209 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  45.63 
 
 
208 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  44.17 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  45.5 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  47.09 
 
 
208 aa  194  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  45.13 
 
 
209 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  45.05 
 
 
213 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  45.21 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  46.19 
 
 
215 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  31.46 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  29.27 
 
 
207 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  32.58 
 
 
223 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
221 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  28.43 
 
 
207 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  29.7 
 
 
221 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 
221 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  29.84 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.85 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 
210 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  28.73 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  29.76 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  24.27 
 
 
259 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  31.61 
 
 
336 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  28.43 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  29.71 
 
 
319 aa  88.6  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
199 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  24.04 
 
 
242 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  24.04 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  26.2 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  27.53 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  27.84 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  22.8 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  25.25 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  23.35 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  29.53 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  27.49 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25.65 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  25.65 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  24.48 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  27.03 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  26.88 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  26.88 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  25.91 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  25.95 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  27.57 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  27.57 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  27.57 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  25.79 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  26.63 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25.56 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  26.17 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  25.54 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  27.7 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  25.79 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  23.91 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  25.99 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.27 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  26.55 
 
 
297 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  25.28 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  23.83 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.98 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.98 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  22.54 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  24.43 
 
 
297 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  24.32 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.98 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  25.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  25.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  25.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  25.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  25.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  25.49 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  25.24 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  21.51 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  33.02 
 
 
203 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>