120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3102 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  46.15 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  46.15 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  45.1 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  42.36 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  46.57 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  38.28 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  46.24 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  46.7 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  43.63 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  43.63 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  44.62 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  45.92 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  36.79 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  33.5 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  35.89 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  34.43 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  34.43 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  31.84 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  31.46 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  33.71 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  39.11 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  31.76 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  35 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  30.68 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.33 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.59 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  29.55 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  28.09 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  25.9 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  27 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  25.84 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  30.94 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  31.87 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25.4 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  30.32 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  29.44 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  30.32 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  26.14 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.79 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  29.28 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  26.74 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  30.43 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  29.19 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  23.12 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  27.42 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.71 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  22.28 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.28 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  21.86 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.76 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  27.51 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  25.26 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.44 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  24.06 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  29.79 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  24.4 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  29.82 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  28.9 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  28.9 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  27.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  24.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  25.27 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  25.81 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  22.83 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.29 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  24.19 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>