127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3568 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  58.94 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  58.08 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  51.21 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  49.51 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  45.54 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  45.37 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  44.44 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  42.65 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  44.81 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  40.3 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  31.82 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  29.59 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.88 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.84 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  25.94 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.5 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  29.03 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.67 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  28.4 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  24.12 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  24.12 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  24.47 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  23.78 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  26.49 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  28.65 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.89 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  23.81 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  27.89 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  28.88 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  27.13 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  28.27 
 
 		 328 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  21.29 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  22.51 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  27.23 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.6 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.19 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  23.74 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  25.26 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  26.96 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  23.32 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  20.77 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  19.7 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  21 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.03 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  25.49 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  21.86 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  22.49 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  23.71 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  21.76 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  23.98 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  23.98 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  23.98 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  24.37 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  23.68 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  25.26 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  23.32 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  25.12 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  22.96 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  23.24 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  22.68 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  24.62 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  23.47 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.5 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  25.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  23.53 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  21.05 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  23.71 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  23.62 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  24.46 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2048  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  24.74 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  21.84 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>