104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002936 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  100 
 
 		 209 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  91.92 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  47 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  45.13 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  45.89 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  47 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  43.84 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  42.65 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  41.06 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  46.77 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  41.83 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  26.19 
 
 		 238 aa  98.2  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  26.19 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  26.59 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  27.68 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  28.72 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  26 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.52 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  25.12 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  26.73 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.41 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  29.83 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  29.03 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  30 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  28.73 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  26.04 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  25.35 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  26.67 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  26.47 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  28.09 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  25.13 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  28.8 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  25.49 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  25.93 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.04 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.3 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  25.53 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  24.49 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  25.42 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.04 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  24.08 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  23.53 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.81 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.09 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  25.33 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  22.28 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  19.37 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  23.12 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  23.12 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  23.12 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  21.36 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  24.12 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  22.37 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  21.81 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  23.28 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  25.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  22.94 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  20.74 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  22.47 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  22.47 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  20.71 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  21.79 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  22.47 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  29.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  22.47 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  22.47 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  22.47 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  29.13 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  22.89 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  29.13 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  23.53 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>