113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1694 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  70.33 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  70.35 
 
 		 200 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  70.67 
 
 		 212 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  64.76 
 
 		 210 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  68.84 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  65.71 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  63.81 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  65.71 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  65.71 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  64.82 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  45.1 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  39.11 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  46.11 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  37.91 
 
 		 223 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  40.28 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  39.42 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  36.67 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  35.44 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  32.64 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 238 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  29.53 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  34.38 
 
 		 244 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  30.35 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.82 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  32.66 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  32.22 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  30.27 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  28.57 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  29.32 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  31.15 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  32.37 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.82 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  33.51 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  30.21 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  35.08 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  29.84 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  35.05 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  29.23 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.15 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  28.06 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  25.63 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  24.34 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  34.95 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  25.64 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  25.4 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  26.49 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  29.85 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  26.26 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  29.23 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  30.93 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  30.1 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  30 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  30.05 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  31.43 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  30.21 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  34.06 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  34.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  34.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  34.06 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  34.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  34.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  34.06 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.8 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.89 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.34 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  28.88 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  27.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  27.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  27.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  30.16 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25.28 
 
 		 336 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  27.67 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  22.17 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  27.32 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  27.18 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  25.65 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  21.29 
 
 		 297 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  30.95 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  25.45 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>