87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2620 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  61.6 
 
 
238 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  60.96 
 
 
242 aa  291  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  64.65 
 
 
200 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  54.32 
 
 
244 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  40.39 
 
 
211 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  42.93 
 
 
200 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 
210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  40.39 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 
210 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 
210 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  39.5 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  41.29 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  34.15 
 
 
207 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  39.42 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  40.84 
 
 
210 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 
221 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  39.79 
 
 
210 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  34.29 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  33.81 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  34.78 
 
 
214 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  33.81 
 
 
210 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  31.05 
 
 
223 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  37.88 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.83 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.52 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.27 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  32.51 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  34.15 
 
 
231 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  30.54 
 
 
215 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.12 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  34.52 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  28.99 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  33.66 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  32.28 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  22.27 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  23.79 
 
 
207 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  26.47 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  27.55 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.24 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  31.86 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.81 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  22.96 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  22.49 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  31.5 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  30.96 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  26.34 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  26.87 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  22.55 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.76 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.53 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.04 
 
 
206 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 
230 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  25.37 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  28.65 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  23.15 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.89 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.04 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 
303 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.96 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  26.85 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  26.6 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  27.04 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.03 
 
 
319 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.96 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  26.78 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  25.25 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  24.75 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  25.25 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 
219 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
225 aa  42  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  25.42 
 
 
297 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.52 
 
 
232 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  24.36 
 
 
220 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>