69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2391 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  100 
 
 
319 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  60.4 
 
 
305 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  58.01 
 
 
336 aa  381  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  54.11 
 
 
328 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  28.01 
 
 
297 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  27.47 
 
 
297 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
303 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  25.19 
 
 
297 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  29.35 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  28.86 
 
 
297 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  28.86 
 
 
297 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  30.35 
 
 
297 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  29.35 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  29.71 
 
 
206 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  25.36 
 
 
207 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  25.38 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  30 
 
 
209 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  24.51 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25.93 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  23.79 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  27.49 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  24.75 
 
 
223 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  23.47 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  27.87 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  28.18 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  23.16 
 
 
212 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  24.2 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  22.39 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.18 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  24.76 
 
 
208 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  24.12 
 
 
210 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.09 
 
 
208 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  23.96 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  22.49 
 
 
215 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 
207 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  23.5 
 
 
212 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  22.22 
 
 
211 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  22.03 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 
221 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  23.66 
 
 
221 aa  53.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 
229 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 
210 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 
210 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  22.77 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  21.47 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.44 
 
 
206 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  21.83 
 
 
210 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  25.23 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  20.28 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  22.22 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2762  hypothetical protein  28.46 
 
 
253 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675681  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0581  hypothetical protein  19.74 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  21.03 
 
 
244 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.03 
 
 
213 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.91 
 
 
221 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  20.42 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  20.28 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  20.43 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  20.28 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 
215 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>