136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1656 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 231 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  60.7 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  25.46 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  25.12 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  24.68 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  24.35 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  31.3 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  23.45 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  23.79 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  25 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  24.57 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  25 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  24.57 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.89 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.4 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  31.37 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  21.52 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  25.71 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  20.86 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.07 
 
 		 349 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 348 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  24.55 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  23.28 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  24.55 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  21.11 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.42 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  31.07 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  23.26 
 
 		 336 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  22.12 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  21.53 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  35.79 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  24.11 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  22.55 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  23.48 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  22.07 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 664 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  20.69 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  24.79 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1026  DSBA oxidoreductase  20.1 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  27.36 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  21.16 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  20.64 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  21.95 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  35.14 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  19.13 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  21.6 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  19.43 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  22.37 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  34.85 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  30.49 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  21.15 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  22.07 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  28.09 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.19 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  24.78 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  19.23 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  21.81 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>