77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1677 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
229 aa  480  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  60.7 
 
 
231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 
223 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 
215 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
220 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
216 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.29 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.29 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  23.75 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  26.76 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.39 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  25.74 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  25.82 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  24.18 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  25.36 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  25.87 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  23.05 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.12 
 
 
319 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  20 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  24.11 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  22.31 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  20.6 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
305 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  20.66 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  23 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  19.21 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  20.64 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  22.08 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  21.84 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  22.36 
 
 
223 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  23.15 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 
212 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  23 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 
232 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  19.3 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  28.1 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  19.3 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  22.27 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  21.33 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  22.57 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.81 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  21.6 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  22.62 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  20 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  22.17 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 
214 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  22.17 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  20 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  18.69 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  23.66 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  19.69 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0747  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.39 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  19.34 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  26.85 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  20.47 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  21.82 
 
 
220 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 
281 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  21.08 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  20.85 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  21.3 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>