150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7778 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  54.95 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  52.53 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  26.92 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6659  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  31.09 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.49 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  26.64 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.12 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  24.32 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  27.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.11 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000899943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.62 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25.41 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  27.62 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  29.61 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000322125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.12 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.62 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  27.75 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.83 
 
 		 336 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.78 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  30.13 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  26.22 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  23.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  25.59 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  22.44 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.12 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359947 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  27.63 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.12 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  23.96 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.21 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.5 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.23 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  23.47 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  36.21 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  22.05 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  26.04 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  22.48 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.62 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.62 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>