181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6659 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6659  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.04 
 
 
215 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
216 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
231 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
215 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  30.73 
 
 
213 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
216 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
248 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  31.4 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
215 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  29.81 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  28.23 
 
 
243 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
211 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  28.92 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  28.44 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  27.55 
 
 
214 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.64 
 
 
219 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
215 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  27.96 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  32.31 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.79 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  27.49 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  30.62 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  30.43 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.96 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  27.96 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  27.27 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  26.79 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  26.79 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.71 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  25.24 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  28.16 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>