87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3237 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  54.95 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  48.04 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  28.34 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  27.85 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  26.6 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  25.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  27.44 
 
 		 328 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  21.51 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  22.17 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  25.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.53 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  33.87 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0747  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  28.92 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25.5 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  25.13 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  31.46 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  25 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  31.46 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.11 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  23.32 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  25.96 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  21.94 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  23.28 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6659  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  20.64 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  28 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.75 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  22.56 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  19.68 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  22.53 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  21.94 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  29.58 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  24.87 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  22.34 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  22.56 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  23.86 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  23.08 
 
 		 221 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 225 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 201 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  20.37 
 
 		 221 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  22.34 
 
 		 243 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 255 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  20.92 
 
 		 206 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 248 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 201 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  22.14 
 
 		 217 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  22.14 
 
 		 216 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  23.66 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  23.66 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  22.56 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  23.66 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  25.22 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>