116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0294 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  58.52 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  58.08 
 
 		 231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  55.84 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  57.69 
 
 		 242 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  54.35 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  57.08 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  53.69 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  54.31 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  53.69 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  52.61 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  48.97 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  53.14 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  53.14 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  53.14 
 
 		 211 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  51.46 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  47.32 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  47.32 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  47.32 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  46.83 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  46.57 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  45.71 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  45.41 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  44.29 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  44.71 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  32.51 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  28.16 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  33.51 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  31.41 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  32.47 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  31.38 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.18 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  26.2 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  30.15 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  29.69 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  27.55 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  30.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  30.16 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  30.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  30.16 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  30.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  30.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  30.16 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  27.57 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  30.11 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  25.13 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.13 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  28.27 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.81 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  26.14 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  23.56 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.56 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.35 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.86 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  24.04 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.95 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.49 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  24.12 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  23.32 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  28.87 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  30.72 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  27.27 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.53 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  21.98 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  24.75 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  23.15 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  24.88 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  24.14 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  21.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  23.76 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.33 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.31 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  22.1 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  23.71 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>