84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1753 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  47 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  47.5 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  44.17 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  46.56 
 
 		 198 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  46.7 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  44.88 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  43.35 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  46.7 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  42.23 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  41.5 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  31.76 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  29.72 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  26.98 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.9 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  26.5 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  23.79 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  24.27 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  28.93 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.29 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  27.07 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  22.92 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  22.92 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 		 300 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  24.62 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  26.44 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.93 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  26.63 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  24.21 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.42 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  22.04 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.86 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  23.74 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  25.64 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.23 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  21.29 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  24.1 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  22.05 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  22.05 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.05 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  21.59 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  26.55 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  26.23 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25.68 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  22.4 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  25.99 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  20.88 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  21.16 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  20.88 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  20.88 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.56 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  23.76 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  25.99 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  22.95 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  23.68 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  23.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  25.6 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>