72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02994 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  91.92 
 
 		 209 aa  387  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  46.56 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  45.21 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  44.39 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  44.27 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  44.21 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  39.29 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  40.3 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  44.94 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.14 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  25.9 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  27.17 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  27.49 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  25.15 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  22.96 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  26.67 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  21.43 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  27.49 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.55 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  23.49 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  25.15 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  26.9 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.44 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  23.76 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.38 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  23.12 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.49 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.73 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  22.47 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.18 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.25 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  25.7 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  26.34 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  28.02 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  24.37 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  22.1 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  23.21 
 
 		 297 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.12 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  24.86 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  24.4 
 
 		 297 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  24.4 
 
 		 297 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  22.73 
 
 		 215 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  23.28 
 
 		 214 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  23.4 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  23.81 
 
 		 297 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  23.81 
 
 		 297 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>