106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3039 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  100 
 
 
206 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  49.27 
 
 
206 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  42.44 
 
 
209 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  33.81 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  33.82 
 
 
233 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  33.66 
 
 
216 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  31.48 
 
 
214 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  31.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  31.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  31.88 
 
 
211 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.53 
 
 
242 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  32.86 
 
 
218 aa  121  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  31.1 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  30.14 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  35.75 
 
 
221 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  32.35 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  34.63 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  33.17 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  28.16 
 
 
222 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  32.68 
 
 
217 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  32.02 
 
 
230 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  30.09 
 
 
256 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  31.03 
 
 
230 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  31.03 
 
 
230 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  30.54 
 
 
230 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  30.73 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.77 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  30.85 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  25.77 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.03 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  26.88 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  26.92 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  27.96 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  30.46 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.46 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  28.96 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  25.65 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  27.18 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  27.18 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.73 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  27.18 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  27.18 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  27.18 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  27.18 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  27.18 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  25.82 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  24.74 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  25 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  25 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  29.15 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  26.57 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.13 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  22.51 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.72 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  23.81 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  27.04 
 
 
259 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.26 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  24.06 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  27.81 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.72 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  22.11 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  25.73 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  25.25 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  23.68 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 
210 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  24.73 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  27.18 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  23.86 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  26.47 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
199 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  27.12 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2944  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 
205 aa  44.7  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  22.68 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  22.82 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  20.89 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  23.59 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  26.5 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.34 
 
 
336 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>