104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1753 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  66.67 
 
 		 231 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  66.38 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  65.13 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  62.38 
 
 		 216 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  59.43 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  58.37 
 
 		 214 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  57.89 
 
 		 214 aa  254  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  55.84 
 
 		 222 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  52.58 
 
 		 218 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  53.81 
 
 		 211 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  53.81 
 
 		 211 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  53.81 
 
 		 211 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  56.28 
 
 		 233 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  52.58 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  58.25 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  49.3 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  48.62 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  49.3 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  49.77 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  47.93 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  47.37 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  45.83 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  46.7 
 
 		 217 aa  178  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  46.7 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  37.09 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  32.08 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.69 
 
 		 209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  40.64 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  34.88 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  37.67 
 
 		 212 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  32.12 
 
 		 210 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  36.95 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.49 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.84 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  32.8 
 
 		 207 aa  88.6  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 210 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  32.49 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  32.49 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  32.49 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  32.49 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  32.49 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  32.49 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  32.49 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  34.03 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  30.56 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  31.87 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.55 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  27.78 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.78 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  26.8 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.86 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  30.73 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  30.1 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.48 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  30.89 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  24.55 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  27.32 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  37.32 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  26.06 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  24.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.83 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.04 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  22.83 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.28 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  22.83 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25.64 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  28.64 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  30.52 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  21.3 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.26 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.85 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  24.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  25.37 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  31.34 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  34.02 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  22.73 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>