18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2060 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  416  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  80.1 
 
 		 216 aa  344  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  68.34 
 
 		 208 aa  307  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  66.83 
 
 		 224 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  64.32 
 
 		 199 aa  287  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  53.85 
 
 		 213 aa  224  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  41.38 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  23.15 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  23.77 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  20 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  20.11 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  20.65 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  20.11 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  21.08 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  21.23 
 
 		 223 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.97 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  27.64 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  21.74 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>