17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2184 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  57.28 
 
 
216 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  55.38 
 
 
208 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  53.85 
 
 
199 aa  224  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  49.32 
 
 
224 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  44.62 
 
 
199 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  35.86 
 
 
206 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  24.26 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  21.74 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  21.74 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  21.74 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  21.74 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  19.81 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.53 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  22.31 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.21 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  22.46 
 
 
210 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>