15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2764 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  64.32 
 
 
199 aa  287  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  60.3 
 
 
208 aa  271  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  58.82 
 
 
216 aa  270  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  58.29 
 
 
224 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  44.62 
 
 
213 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  44.06 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  21.24 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  23.74 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.29 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  21.97 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  23 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25.36 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  18.89 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  23.56 
 
 
214 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>