22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0581 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0581  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1019  hypothetical protein  89.02 
 
 
268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0792932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1000  hypothetical protein  89.02 
 
 
268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  33.21 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  31.2 
 
 
297 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  32.46 
 
 
297 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  31.72 
 
 
297 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  32.09 
 
 
297 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  31.72 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  30.6 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  30.6 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  31.34 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  22.84 
 
 
305 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.14 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0571  hypothetical protein  20.1 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000205324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  20 
 
 
319 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0522  hypothetical protein  24.46 
 
 
193 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  20 
 
 
300 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>