12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2762 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2762  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675681  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 
305 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  28.66 
 
 
336 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  27.27 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3475  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.97 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.29 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  30.49 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  26.04 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>