More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0042 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  85.47 
 
 
353 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  79.89 
 
 
351 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.79 
 
 
353 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.29 
 
 
353 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.64 
 
 
355 aa  517  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0266  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.11 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  72.93 
 
 
359 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0227  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
353 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.6 
 
 
357 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.99 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 
355 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0494  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.96 
 
 
352 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
336 aa  317  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
365 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
349 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
349 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.86 
 
 
349 aa  298  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
349 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
348 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
347 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
348 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
340 aa  295  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
349 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.43 
 
 
341 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
347 aa  291  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
341 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
342 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.69 
 
 
340 aa  289  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
348 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.73 
 
 
350 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
351 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
344 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
348 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.2 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.42 
 
 
355 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
339 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
339 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
339 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
353 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.82 
 
 
339 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
341 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.86 
 
 
347 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.68 
 
 
347 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.47 
 
 
351 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
338 aa  275  7e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
338 aa  275  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
354 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0064  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  44.25 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
334 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0067  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
340 aa  272  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.62 
 
 
345 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28856  predicted protein  40.35 
 
 
383 aa  272  6e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606954  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.46 
 
 
365 aa  272  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00711  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
343 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
352 aa  272  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
339 aa  271  9e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
349 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
332 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
351 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
349 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.89 
 
 
340 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
340 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2241  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
347 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.363521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1641  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
332 aa  269  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000438606  normal  0.466828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
351 aa  268  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
340 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
340 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
340 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
344 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
344 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
338 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.11 
 
 
342 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
329 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  45.95 
 
 
339 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.33 
 
 
333 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
349 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0306509  normal  0.940701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0277  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  40.4 
 
 
340 aa  265  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.125695 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
336 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
340 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.44 
 
 
328 aa  264  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>