More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0203 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  37.07 
 
 
1377 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.01 
 
 
1241 aa  975    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  43.87 
 
 
1241 aa  974    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.95 
 
 
1241 aa  978    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.93 
 
 
1241 aa  976    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.62 
 
 
1240 aa  970    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.65 
 
 
1230 aa  922    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.19 
 
 
1241 aa  979    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  100 
 
 
1233 aa  2479    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  43.87 
 
 
1241 aa  974    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  52.15 
 
 
1251 aa  1288    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  41.67 
 
 
1244 aa  904    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.03 
 
 
1405 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  33.56 
 
 
1282 aa  703    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.22 
 
 
1241 aa  979    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  43.67 
 
 
1242 aa  976    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  48.97 
 
 
1271 aa  1155    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  42.25 
 
 
1242 aa  911    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  49.17 
 
 
1270 aa  1157    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  49.28 
 
 
1248 aa  1200    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  42.04 
 
 
1236 aa  911    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  43.88 
 
 
1244 aa  1020    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.24 
 
 
1241 aa  976    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  33.53 
 
 
1392 aa  721    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  44.22 
 
 
1241 aa  982    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  33.86 
 
 
1217 aa  619  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  33.86 
 
 
1217 aa  619  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  33.12 
 
 
1218 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  32.91 
 
 
1204 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.82 
 
 
1230 aa  528  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.34 
 
 
1186 aa  494  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 
1121 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  30.88 
 
 
1392 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 
1240 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  30.5 
 
 
1207 aa  446  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.85 
 
 
1203 aa  442  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.46 
 
 
1217 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 
1184 aa  245  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 
1149 aa  213  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.03 
 
 
1057 aa  194  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.3 
 
 
1061 aa  193  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 
1080 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.37 
 
 
1139 aa  185  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  25.37 
 
 
1180 aa  178  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 
1123 aa  177  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  25.16 
 
 
1180 aa  174  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.89 
 
 
1262 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 
1115 aa  163  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 
1173 aa  158  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  23.94 
 
 
833 aa  157  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 
1165 aa  155  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 
1110 aa  154  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.47 
 
 
1089 aa  153  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  23.86 
 
 
1180 aa  151  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  25.7 
 
 
1124 aa  150  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.75 
 
 
1226 aa  148  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  24.01 
 
 
1182 aa  146  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 
1107 aa  145  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.13 
 
 
1177 aa  142  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.3 
 
 
1118 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 
1185 aa  140  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 
1165 aa  139  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  22.18 
 
 
1164 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 
1162 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 
1074 aa  135  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.57 
 
 
1089 aa  135  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 
1161 aa  134  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 
1147 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  22.98 
 
 
1061 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.29 
 
 
1135 aa  131  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  22.33 
 
 
1087 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 
1173 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  24.12 
 
 
1164 aa  128  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  21.25 
 
 
1161 aa  129  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 
1168 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 
1117 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  23.24 
 
 
1177 aa  125  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  22.03 
 
 
1156 aa  125  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 
1065 aa  125  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 
1121 aa  125  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  23.49 
 
 
1125 aa  125  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  22.88 
 
 
1124 aa  124  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 
1130 aa  123  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  22 
 
 
1161 aa  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 
854 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.73 
 
 
772 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  23.93 
 
 
1183 aa  121  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.98 
 
 
776 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  21.53 
 
 
1157 aa  120  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 
1095 aa  120  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  25.37 
 
 
1183 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 
805 aa  119  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.04 
 
 
805 aa  119  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.3 
 
 
1155 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 
1202 aa  118  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 
1146 aa  116  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 
1110 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  25.7 
 
 
1167 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.4 
 
 
773 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.36 
 
 
1130 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>