More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3437 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  222  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  71.15 
 
 
105 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  69.61 
 
 
105 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  62.5 
 
 
105 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  62.5 
 
 
105 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  61.54 
 
 
105 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  59.62 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  48.48 
 
 
125 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  46.08 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  51.76 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  51.11 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.83 
 
 
107 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  49.47 
 
 
108 aa  105  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  46.81 
 
 
103 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  49.47 
 
 
120 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  49.47 
 
 
110 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  44.79 
 
 
107 aa  105  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  44.44 
 
 
142 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  48.24 
 
 
141 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.79 
 
 
107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.44 
 
 
115 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.92 
 
 
108 aa  104  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.79 
 
 
107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  44.79 
 
 
107 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49.41 
 
 
107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.21 
 
 
107 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  46.59 
 
 
117 aa  103  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  53.93 
 
 
98 aa  103  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  53.93 
 
 
127 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  45.74 
 
 
107 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  44.19 
 
 
145 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  45.36 
 
 
112 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  42.71 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  44.19 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  42.71 
 
 
107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.67 
 
 
148 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.68 
 
 
107 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.81 
 
 
106 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.68 
 
 
107 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  45.74 
 
 
108 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  51.14 
 
 
98 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  43.16 
 
 
109 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.11 
 
 
107 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  44.44 
 
 
145 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.11 
 
 
107 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  46.24 
 
 
146 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.11 
 
 
124 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  44.68 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  45.26 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  40.2 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  42.71 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  44.79 
 
 
109 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  42.27 
 
 
110 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  47.06 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  42.27 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  42.27 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  42.27 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  45.36 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  42.86 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.94 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  44 
 
 
116 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  46.07 
 
 
150 aa  97.1  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  41.05 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  40 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  46.99 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  42.86 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  39.18 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  41.05 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  41.41 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  47.87 
 
 
108 aa  96.7  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  43.16 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  48.78 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  37.86 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  48.78 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  43 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.5 
 
 
105 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  43.75 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  43.33 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  44.9 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  42.22 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  45.26 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  48.19 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  39.78 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  42.71 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  43.62 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  46.51 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  45.88 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  42.22 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  40.43 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  47.56 
 
 
104 aa  94.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  42.05 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5108  Thioredoxin domain protein  38.53 
 
 
110 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  38.14 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  46.51 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  37.11 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  39.18 
 
 
223 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  44.9 
 
 
302 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>