274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0471 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0471  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 355 aa  727    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000021987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  26.48 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  27.15 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 686 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  28.17 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  34.86 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.15 
 
 		 857 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 841 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 494 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 537 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 842 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 841 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 711 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 858 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  23.11 
 
 		 728 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 701 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 706 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.85 
 
 		 500 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  23.32 
 
 		 728 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 693 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 763 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 903 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 678 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  36.27 
 
 		 248 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  30.85 
 
 		 600 aa  49.3  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.91 
 
 		 853 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 838 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 763 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  21.67 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  34.83 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 490 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 763 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 870 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  31.11 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 482 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0383  histidine kinase  31.13 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2452  histidine kinase  24.07 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 835 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  22.17 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 885 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 835 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 885 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 697 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 835 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 879 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 871 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 879 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 		 545 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 403 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 846 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 587 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  32.14 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.15 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.46 
 
 		 610 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  23.46 
 
 		 610 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.46 
 
 		 610 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  42.59 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  26 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001060  signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 476 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 678 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 		 503 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  22.65 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 688 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  33.33 
 
 		 614 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 887 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  28.81 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 622 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 560 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 553 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 887 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 680 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>