More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2458 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
450 aa  895    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  73.72 
 
 
450 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.02 
 
 
463 aa  611  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.52 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  63.52 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.62 
 
 
454 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  66.23 
 
 
513 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  68.57 
 
 
454 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.09 
 
 
503 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.93 
 
 
517 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  64.4 
 
 
493 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  63.42 
 
 
519 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  62.45 
 
 
509 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.76 
 
 
491 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.7 
 
 
480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  63.76 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  65.45 
 
 
541 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  64.21 
 
 
500 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  62.2 
 
 
509 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  63.78 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.82 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  60.34 
 
 
529 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  63.76 
 
 
488 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  65.43 
 
 
476 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  61.96 
 
 
479 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  60 
 
 
529 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  61.28 
 
 
515 aa  498  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  62.04 
 
 
485 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  64.98 
 
 
529 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  62.04 
 
 
485 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.04 
 
 
486 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  62.04 
 
 
485 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  65 
 
 
504 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  62.44 
 
 
481 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  62.04 
 
 
482 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  61.61 
 
 
480 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  56.3 
 
 
563 aa  465  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  55.67 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.53 
 
 
426 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.07 
 
 
464 aa  346  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.71 
 
 
463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  56.52 
 
 
338 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  47.72 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.02 
 
 
428 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.35 
 
 
464 aa  322  7e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  48 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 
425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  45.62 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.6 
 
 
430 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.6 
 
 
430 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  46.46 
 
 
424 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.31 
 
 
482 aa  317  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  45.92 
 
 
422 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.58 
 
 
435 aa  316  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.12 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.62 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  46.08 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.39 
 
 
428 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.16 
 
 
428 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.16 
 
 
428 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.39 
 
 
428 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  44.93 
 
 
428 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  44.93 
 
 
428 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  54.72 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.71 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  42.55 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.39 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  44.11 
 
 
430 aa  305  7e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.36 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  44.47 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  53.77 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  53.77 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.57 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.8 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  42.69 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.08 
 
 
435 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.39 
 
 
354 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.39 
 
 
354 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.99 
 
 
417 aa  299  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  44 
 
 
424 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.39 
 
 
354 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.82 
 
 
458 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  43.09 
 
 
427 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.67 
 
 
434 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  43.29 
 
 
424 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.82 
 
 
353 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.17 
 
 
452 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.84 
 
 
338 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  42.82 
 
 
424 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.15 
 
 
338 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.19 
 
 
426 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  48.48 
 
 
423 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  50.7 
 
 
425 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  43.96 
 
 
437 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.86 
 
 
439 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.81 
 
 
415 aa  285  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.97 
 
 
387 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  42.7 
 
 
437 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  42.49 
 
 
428 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.82 
 
 
429 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>