69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1977 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 328 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  59.16 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  55.81 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  48.87 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  46.67 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.27 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.64 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  46.64 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  48 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  45.83 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  40.78 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  41.27 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.96 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  40.69 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  43.54 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  45.19 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  44.07 
 
 		 342 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  44.81 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  43.69 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  41.37 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  40.88 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  38.73 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  41.3 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.55 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  42.5 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  39.75 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  39.01 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  40.64 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  40.59 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  40.58 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  36.9 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.73 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  39.43 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  39.42 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.36 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.56 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  32.5 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.53 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  36.76 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25.35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  38.32 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.79 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  25.24 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  25.14 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  29.28 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 622 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  46 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  48.72 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  23.81 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.79 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.32 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  25.49 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.49 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  32.48 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  28.87 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.85 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  27.63 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  31.67 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  39.62 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  28.03 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  38.1 
 
 		 318 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>