More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1076 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  67.55 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  37.59 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.65 
 
 		 240 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  34.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  34.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.65 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1226  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 259 aa  70.5  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 252 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  53.85 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  48.48 
 
 		 368 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  41.76 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 244 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  49.3 
 
 		 246 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  43.02 
 
 		 241 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  38.46 
 
 		 262 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  48.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  48.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  46.27 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  48.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  45.31 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  48.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  48.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  43.75 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  43.75 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  45.31 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  43.75 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  43.75 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.77 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  39.77 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.29 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  43.75 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  41.86 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  41.86 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  41.86 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  43.48 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  41.86 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 248 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  45.45 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  47.69 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  44.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  46.27 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 253 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1646  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.041881  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.65 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  45.59 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  41.43 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  45.59 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  45.45 
 
 		 342 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  41.18 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  42.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.26 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  46.27 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>