59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1837 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  59.52 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  48.91 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  48.7 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  47.41 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  46.72 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  43.45 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  48.7 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  44.27 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  49.56 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  43.51 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  36.48 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  42.62 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  36.71 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  37.5 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  43.18 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  37.06 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  35.34 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  37.76 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  34.68 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  32.52 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  37.16 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  30.19 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  29.57 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  28.7 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  31.86 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  33.93 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.57 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  27.52 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  32.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.17 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  32.23 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  30.53 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  26.72 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  33.61 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.95 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  31.29 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  29.29 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  29.7 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  28.81 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  26 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  28.07 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  26.45 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  28.57 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  29.06 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  30.4 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  23.13 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  37.25 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.24 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>