218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1472 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  97.26 
 
 		 474 aa  944    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  964    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  63.35 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  58.71 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  55.32 
 
 		 484 aa  518  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  52.41 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  52.98 
 
 		 480 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  52.98 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  51.77 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  53.15 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  51.14 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  53.86 
 
 		 486 aa  501  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  51.14 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  53.35 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50.52 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  51.72 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.37 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  52.51 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  50 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  52.61 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  51.36 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  55.05 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  52 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  49.58 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  48.74 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  49.37 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  50.21 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.27 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  47.19 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  48.41 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  48.84 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  48 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.26 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  47.28 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  48.13 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  46.84 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.28 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  48.33 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  49.68 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  47.94 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  49.16 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  49.17 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  52.06 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  48.76 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  48.34 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  46.65 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  46.78 
 
 		 485 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  45.83 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  47.51 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  44.91 
 
 		 485 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  47.3 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  45.75 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  47.47 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  46.84 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  45.02 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  48.1 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  44.93 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  48.54 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  44.3 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  45.13 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  45.89 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  48.39 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  46.12 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  52.44 
 
 		 988 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  48.73 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  49.43 
 
 		 432 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  48.96 
 
 		 963 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  46.22 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  46.58 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.97 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  46.12 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  45.74 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 		 475 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  43.44 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  43.48 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.63 
 
 		 447 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  33.92 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  29.37 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  30.8 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.54 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.59 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.01 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  33.82 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  30.7 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  29.79 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.86 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.63 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.28 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  31.06 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.91 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  32.16 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  32.22 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  32.61 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  31.87 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  30.55 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.74 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  32.25 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  30.99 
 
 		 404 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.89 
 
 		 384 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>