More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3263 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.64 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.73 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.57 
 
 		 486 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.25 
 
 		 493 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 492 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 489 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.73 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.37 
 
 		 489 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.88 
 
 		 500 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.73 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 511 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 494 aa  646    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.03 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.78 
 
 		 484 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.64 
 
 		 483 aa  634    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.67 
 
 		 483 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.11 
 
 		 492 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  993    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.46 
 
 		 490 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.64 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  64.73 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.73 
 
 		 489 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 492 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.16 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.64 
 
 		 483 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.6 
 
 		 486 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.96 
 
 		 489 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.64 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.79 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.79 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.32 
 
 		 488 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.58 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.62 
 
 		 480 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 484 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.3 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 485 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.99 
 
 		 480 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.36 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.2 
 
 		 480 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.14 
 
 		 503 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.2 
 
 		 480 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.79 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.45 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.45 
 
 		 480 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.06 
 
 		 488 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.64 
 
 		 483 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.81 
 
 		 503 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.99 
 
 		 480 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.03 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.02 
 
 		 483 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.71 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.84 
 
 		 486 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.03 
 
 		 482 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  62.86 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.66 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.86 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.86 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  63.88 
 
 		 480 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.66 
 
 		 482 aa  614  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.86 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  62.86 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.66 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.84 
 
 		 486 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.99 
 
 		 490 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.49 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.03 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.54 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.33 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.51 
 
 		 479 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.83 
 
 		 486 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.78 
 
 		 500 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 		 484 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.12 
 
 		 483 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0580  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.66 
 
 		 480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  59.88 
 
 		 482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.83 
 
 		 491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.82 
 
 		 493 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  59.79 
 
 		 491 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  60.82 
 
 		 497 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0465  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.71 
 
 		 497 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  58 
 
 		 490 aa  601  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 486 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 486 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.84 
 
 		 479 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>