More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0571 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  100 
 
 
494 aa  1012  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 
458 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
458 aa  459  1e-128  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 
458 aa  458  1e-128  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 
457 aa  460  1e-128  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
458 aa  461  1e-128  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 
457 aa  452  1e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  49.24 
 
 
459 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
484 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 
454 aa  446  1e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 
454 aa  446  1e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 
457 aa  443  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 
470 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  47.2 
 
 
448 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  45.47 
 
 
453 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  47.01 
 
 
449 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.97 
 
 
453 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 
449 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 
450 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 
450 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  47.68 
 
 
453 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 
454 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.99 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 
454 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.22 
 
 
448 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 
457 aa  417  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 
457 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  46.68 
 
 
453 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.67 
 
 
457 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 
463 aa  412  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 
489 aa  405  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 
455 aa  407  1e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.36 
 
 
452 aa  406  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 
451 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 
452 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  46.21 
 
 
449 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 
462 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 
408 aa  400  1e-110  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 
451 aa  400  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 
462 aa  400  1e-110  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 
461 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 
451 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 
451 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  44.81 
 
 
458 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.89 
 
 
453 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 
451 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.55938e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 
456 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  44.52 
 
 
453 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  46 
 
 
462 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 
456 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 
458 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  2.51063e-05 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 
447 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  41.72 
 
 
476 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  46 
 
 
464 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  45.01 
 
 
455 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 
452 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  41.5 
 
 
507 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 
458 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 
466 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 
462 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  44.55 
 
 
448 aa  391  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  47.63 
 
 
452 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 
452 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  46.62 
 
 
445 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 
415 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  45.37 
 
 
458 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  41.34 
 
 
520 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 
478 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 
453 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  44.93 
 
 
453 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 
457 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4932  DNA repair protein RadA  45.81 
 
 
457 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 
453 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  44.88 
 
 
446 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 
514 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  43.76 
 
 
454 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  43.58 
 
 
467 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 
514 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 
456 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 
465 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  44.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 
453 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 
458 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 
453 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 
455 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 
450 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>