More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0221 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  47.03 
 
 		 199 aa  190  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.47 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  49.16 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.62 
 
 		 222 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  47.9 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.1 
 
 		 227 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  49.1 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  49.1 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  49.1 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.25 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  45.16 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  44.09 
 
 		 250 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 		 243 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  46.24 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 166 aa  174  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 166 aa  174  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  45.98 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  49.1 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 173 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  44.32 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  44.51 
 
 		 329 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  51.01 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  48.15 
 
 		 175 aa  167  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 225 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.43 
 
 		 401 aa  165  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 172 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.97 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 277 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  46.91 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  44.38 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  44.63 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  51.88 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 356 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  45.62 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 232 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  45.68 
 
 		 396 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  46.47 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 252 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 233 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 177 aa  160  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 145 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  45.39 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  51.33 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.58 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>