53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10688 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  473  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  70.64 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  71.37 
 
 		 243 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  71.37 
 
 		 243 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  71.37 
 
 		 243 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  66.38 
 
 		 244 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  46.35 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6140  putative transcriptional regulator, PaaX family  53.39 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.192867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  25.29 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  32.05 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  28.63 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  30.18 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  30.57 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  31.87 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  28.25 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  25.51 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  26.73 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  27.07 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  29.46 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  29.49 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  21.21 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  24.24 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  27.68 
 
 		 306 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  25.42 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  27.27 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  27.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  27.1 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.49 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  26.39 
 
 		 318 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  29.49 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  29.75 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  29.11 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  26.15 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  25.66 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  29.03 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>