15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3911 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00945  PaaX-like protein  54.81 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  44.64 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0524  hypothetical protein  46.22 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  44.59 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  25.36 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  26.15 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  24.88 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  25.57 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>