More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10585 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  784    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  48.72 
 
 
394 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  46.45 
 
 
389 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  44.81 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  43.46 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  42.98 
 
 
400 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  41.78 
 
 
399 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  40.63 
 
 
377 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  42.52 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  39.36 
 
 
424 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  40.05 
 
 
400 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.5 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  41.21 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  36.52 
 
 
402 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  40.63 
 
 
372 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  41.24 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  41.91 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  37.57 
 
 
424 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  36.71 
 
 
402 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  37.9 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  34.28 
 
 
418 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  38.64 
 
 
393 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  34.31 
 
 
397 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.17 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  36.25 
 
 
398 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.07 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  35.48 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  35.5 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.74 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
413 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  33.84 
 
 
400 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  37.61 
 
 
393 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
388 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.61 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 
415 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  32.81 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  31.86 
 
 
384 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.69 
 
 
381 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  34.78 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  33.5 
 
 
400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  33.5 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  33.5 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  32.05 
 
 
395 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.71 
 
 
396 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.9 
 
 
496 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  34.57 
 
 
411 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.96 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.17 
 
 
423 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 
392 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
371 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.78 
 
 
405 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  31.84 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  29.48 
 
 
415 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.63 
 
 
434 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  32.28 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.35 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  32.99 
 
 
351 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 
373 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.01 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  27.92 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.69 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  28.34 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
369 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
404 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.88 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.12 
 
 
373 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.33 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.27 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.19 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.56 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.86 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.65 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  26.11 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.15 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.15 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.54 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.33 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  20.5 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.14 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.73 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  23.82 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  24.62 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.46 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  23.82 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  23.48 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.9 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  25.32 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.6 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.6 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>