More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0915 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  67.36 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 153 aa  199  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 153 aa  199  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.13 
 
 		 150 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  65.28 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.09 
 
 		 152 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.94 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.76 
 
 		 184 aa  178  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 149 aa  176  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  58.99 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 148 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  63.24 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  57.43 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.11 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  58.11 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 207 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.47 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.2 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  55.24 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  56.08 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  56.08 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  56.08 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>