More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1037 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
337 aa  695    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 
337 aa  607  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.38 
 
 
337 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.97 
 
 
337 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.67 
 
 
337 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.57 
 
 
337 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.21 
 
 
355 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 
338 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 
338 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.54 
 
 
336 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 
338 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.48 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.15 
 
 
337 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.15 
 
 
335 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.94 
 
 
336 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.94 
 
 
336 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 
339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.75 
 
 
335 aa  458  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  61.7 
 
 
342 aa  423  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  55.9 
 
 
360 aa  385  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
336 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
345 aa  342  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
348 aa  342  7e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
335 aa  338  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
339 aa  335  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
350 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
347 aa  334  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
328 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
344 aa  330  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 
348 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 
349 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
347 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
354 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
350 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  49 
 
 
355 aa  328  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
344 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
329 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
329 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
334 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
332 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
332 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
329 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
339 aa  322  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
345 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
344 aa  322  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
329 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
344 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
332 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
332 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
355 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
336 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
355 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
332 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
334 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
329 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 
331 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
332 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
335 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
351 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
332 aa  316  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
346 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 
341 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
334 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
347 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
338 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
336 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
334 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
333 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
328 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
334 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
344 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
334 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
357 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>