More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0316 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  80.22 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  70.92 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  61.51 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  58.48 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.4 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  56.12 
 
 		 281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.76 
 
 		 281 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  58.48 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  55.4 
 
 		 281 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  48.56 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 293 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  44.57 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  39.73 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  41.3 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  42.01 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  42.29 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  38.54 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.52 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  43.01 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  43.01 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  43.01 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.9 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.49 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.51 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  39.79 
 
 		 366 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.19 
 
 		 386 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  45.49 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  32.62 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.49 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  38.75 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  38.75 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  38.19 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  44.19 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.08 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  37.93 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.44 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  38.87 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.68 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.72 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  38.05 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.92 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.4 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.85 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  34.6 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  38.49 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.72 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  41.2 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40.74 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.81 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  33.81 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.51 
 
 		 362 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  35.83 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  34.95 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  34.95 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  38.38 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.89 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.29 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.89 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  34.51 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  34.95 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.24 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  36.93 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.69 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.54 
 
 		 371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  34.7 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  37.76 
 
 		 379 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  34.6 
 
 		 364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 317 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  35.83 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  34.15 
 
 		 374 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.6 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  38.95 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  34.26 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36.93 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  39.72 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  34.74 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  38.79 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  38.35 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  33.56 
 
 		 365 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 358 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.33 
 
 		 402 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.6 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>