More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0110 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 509 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 573 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 488 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 573 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  74.15 
 
 		 513 aa  766    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 561 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  86.83 
 
 		 502 aa  884    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 573 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1022    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 512 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  66.87 
 
 		 504 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  74.15 
 
 		 513 aa  766    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  73.2 
 
 		 503 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  78.67 
 
 		 508 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 512 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 		 512 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  59.75 
 
 		 485 aa  584  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  56.87 
 
 		 607 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 493 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 489 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 495 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 495 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.25 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 499 aa  501  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 503 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 492 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  51.52 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 509 aa  485  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 631 aa  482  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 508 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 494 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 523 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.1 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>