253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1925 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  100 
 
 		 387 aa  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  51.41 
 
 		 410 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  51.41 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  51.66 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  54.81 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  55.36 
 
 		 574 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  52.24 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  50.51 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  49.36 
 
 		 579 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  50.76 
 
 		 573 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  51.61 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  50.76 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  48.35 
 
 		 581 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  48.72 
 
 		 582 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  52.16 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  52.3 
 
 		 573 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  49.35 
 
 		 582 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  50.77 
 
 		 549 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  50.55 
 
 		 576 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  50 
 
 		 582 aa  359  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  54.37 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  50.39 
 
 		 590 aa  356  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  50.13 
 
 		 578 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  49.62 
 
 		 580 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  48.67 
 
 		 583 aa  345  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  49.47 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  51.68 
 
 		 523 aa  342  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  48.94 
 
 		 578 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  45.57 
 
 		 594 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  45.92 
 
 		 572 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  52.49 
 
 		 418 aa  338  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  49.6 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  45.66 
 
 		 572 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  50.14 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  47.7 
 
 		 606 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  48.87 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  46.63 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  48.04 
 
 		 582 aa  332  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  51.7 
 
 		 569 aa  332  7.000000000000001e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  49.37 
 
 		 585 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  53.41 
 
 		 593 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  42.89 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  46.63 
 
 		 598 aa  325  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  52.35 
 
 		 582 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  52.35 
 
 		 582 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  53.09 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  48.47 
 
 		 587 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  47.21 
 
 		 666 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  46.6 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  50 
 
 		 615 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  48.77 
 
 		 581 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  46.3 
 
 		 574 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  47.16 
 
 		 585 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  49.54 
 
 		 582 aa  311  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  47.26 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  50.29 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  46.3 
 
 		 582 aa  309  6.999999999999999e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  46.06 
 
 		 619 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  45.43 
 
 		 696 aa  305  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  44.7 
 
 		 696 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  45.16 
 
 		 644 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  45.41 
 
 		 587 aa  298  9e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  42.59 
 
 		 625 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  43.99 
 
 		 577 aa  295  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  45.1 
 
 		 562 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  42.75 
 
 		 601 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  42.46 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  42.11 
 
 		 566 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  45.98 
 
 		 659 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  43.07 
 
 		 644 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  40.51 
 
 		 596 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  41.23 
 
 		 1150 aa  255  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  42.82 
 
 		 569 aa  249  8e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  39.3 
 
 		 667 aa  233  5e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  36.43 
 
 		 653 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  35.1 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  40.82 
 
 		 645 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  40.82 
 
 		 645 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  36.96 
 
 		 666 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  30.75 
 
 		 473 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  29.12 
 
 		 490 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  29.53 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  28.61 
 
 		 493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  26.48 
 
 		 531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33268  nuclear architecture related protein  23.74 
 
 		 545 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03632  iron-sulfur cluster assembly associated protein Nar1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11960)  27.2 
 
 		 590 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.436133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  30.58 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  26.95 
 
 		 508 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  29.87 
 
 		 483 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  27.3 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  28.33 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  29.72 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  27.2 
 
 		 482 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  26.22 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  24.23 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  27.55 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  27.25 
 
 		 583 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  27 
 
 		 482 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.01 
 
 		 756 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  25.12 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>