More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4483 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  71.37 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  67.83 
 
 		 260 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  46.27 
 
 		 241 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  47.45 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  46.06 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  44.27 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  47.22 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  46.43 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  45.67 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  46.43 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  45.63 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  44.4 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  47.04 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  45.85 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  44.88 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  45.82 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  47.83 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  43.75 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  45.24 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  46.03 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  43.68 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  44.57 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  45.31 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  43.75 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  41.8 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  41.8 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  41.96 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  40.7 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  42.06 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  40 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  37.4 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  41 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  41.02 
 
 		 282 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  41.51 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  36.47 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  37.79 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  37.4 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  40.55 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  37.07 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  39 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  38.33 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  36.28 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  35.4 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  29.7 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  36.54 
 
 		 400 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.59 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.75 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.13 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  34.26 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.96 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  29.88 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.81 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  30.84 
 
 		 364 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.51 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  30.62 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  34.43 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  34.02 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 341 aa  94  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  33.2 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 		 373 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.7 
 
 		 355 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.13 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.19 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.17 
 
 		 376 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  33.8 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 		 342 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  28.83 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  31.28 
 
 		 339 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.13 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  32.35 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  31.84 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  28.46 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  30.8 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  34.84 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  25.98 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  29.96 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  28.05 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  33.92 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.63 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  28.23 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  27.82 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  30.88 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  31.07 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  27.54 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  30.68 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  28 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  30.5 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.4 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>