279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4208 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  100 
 
 		 391 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  75.13 
 
 		 413 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  48.46 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  48.71 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  47.84 
 
 		 414 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  46.82 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  46.08 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  47.07 
 
 		 413 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  48.25 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  45.94 
 
 		 411 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  47.84 
 
 		 419 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  43.7 
 
 		 406 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  45.29 
 
 		 420 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  45.5 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  46.76 
 
 		 412 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  44.99 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  44.3 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  44.99 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  43.33 
 
 		 415 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  43.7 
 
 		 413 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  43.72 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  42.47 
 
 		 403 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  43 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  43 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  39.49 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  39.29 
 
 		 412 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  39.54 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  40.81 
 
 		 461 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  39.64 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  45.14 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  39.03 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  41.09 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  41.62 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  38.42 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  36.97 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  38.21 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  35.63 
 
 		 433 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  37.47 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  35.15 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  37.16 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  35.96 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.8 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.59 
 
 		 486 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.58 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.44 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.64 
 
 		 434 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.43 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.96 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.16 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.78 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.25 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.01 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  32.92 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.95 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.74 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  32.01 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.81 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.33 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.37 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.16 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.27 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.44 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.25 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.77 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.5 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.64 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.93 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.64 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.81 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  32.02 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.15 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.76 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.89 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.23 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  29.88 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.15 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.3 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.03 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.37 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.39 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.69 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.45 
 
 		 423 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.33 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.42 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.07 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.07 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.42 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.98 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.07 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.42 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.42 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.42 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  33.86 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.65 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.97 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.54 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.77 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.06 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.6 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>